2021年5月31日 星期一

[遠距上班日報]20210531下班

今日任務及進度回報:

  • 桃療IRB確認所有文件無誤,已寄信給唐主任並請主任送件
  • 桃療期中報告撰寫
  • 中風AI之後之資料處理:
    • 初步之分工步驟(未完成)
    • 將原本之影片畫面自中間對分,分別儲存成不同檔案(改變畫面大小)(預計執行人員:PCL)。
    • 各向度之子題目分別分割成不同影片(將原本1小時左右支影片切成各個小片段,每個片段約5~6分鐘)。
      • 使用excel檔案寫下每個動作的起始與結束時間(預計執行人員:YTC)。
        • 每個向度的各個小題皆有可能包含1個以上之動作,需注意標記的時間點為每個動作的起始與結束時間,而非每小題之起始及結束時間。因此,剪輯結束後應有超過28題之動作。
        • 部分動作於拍攝時可能因個案時間關係而調整,因此,紀錄時應紀錄最完整之拍攝時間軸(每題有示範、健側練習、患側練習、患側正式測驗1、患側正式測驗2),若個案施測時有遺漏則視為missing。
      • 以程式語言或手動方式剪輯影片,將各動作切成小影片片段(預計執行人員:YTC、PCL,視影片大小、影體設備進行分工)。
      • 切割完畢後分類各個影片,並以codename的方式標記每個動作,使每個影片都有固定之檔案名稱,以利之後進行自動化分析。(預計執行人員:YTC、PCL)
    • 自動化分析流程:
      • Openpose標記關節點。
        • 各影片完成後開始進行分析,可先寫自動讀檔及跑分析之程式。
        • 目前可能遇到之困難為:因分析初步結果時使用的為免安裝之版本,並非使用Python進行分析。然而,免安裝版本使用的是不同的程式跑程式語言,需確認該程式是否可結合Python,以達到自動化分析。若無法結合,或結合之技術過於困難,則考慮安裝Python之版本,以進行後續之分析
  • 確認AI-DVT之影片品質:使用Openpose標註各影片之臉部標記點,並確認標記之品質。若品質不如預期,則可能可於再測時進行補拍。
  • ABC-ML重新審視是否需要重跑分析及撰寫稿件之修改
    • 確認各階段流程
    • 確認分析結果及分析反應性
    • 撰寫初步結果
    • 修改本日寫作課之問題後,英文給Lynn批改及討論
  • 安排WJS之Python課程
    • 預計6/5開始,每周六下午授課,每次課程2小時,1小時授課,1小時實作,中間穿插休息
    • 課程內容
      •  6/5:檔案系統的使用(檔案及目錄管理、檔案讀寫;自動讀取固定資料夾之檔案後、自動設定作業環境等)
      •  6/12:尚未安排內容

[遠距上班日報]20210531上班

 今日預計任務:

  • 應用於精神科個案之OT評估測驗之整理
    • 電腦化測驗之連結
    • 紙本測驗之表單
    • 各測驗之使用手冊(Deadline5/31)
      • 與SCL、GHL確認羅序分數、信度、T分數及量尺分數之意義及撰寫剩餘3個測驗之計分方式及分數解讀。
      • C-DVT校對
      • T-SDMT撰寫(分配給YTC,請他使用目前之格式補充之前沒寫之處)
      • CAT-SK撰寫(YTC已回傳,彙整心理計量特性中,今日進度60%)
      • CAT-FER撰寫
      • COTIME撰寫(彙整心理計量特性中,今日進度60%)
  • ABC-ML重新審視是否需要重跑分析及撰寫稿件之修改
    • 確認各階段流程
    • 確認分析結果及分析反應性
    • 撰寫初步結果
  • 桃療期中報告撰寫
  • 桃療IRB確認所有文件無誤後將請唐主任送件
  • 安排WJS之Python課程
  • 10:00寫作課
  • 與老師確認是否有其他任務

2021年5月28日 星期五

[遠距上班日報]20210528下班

今日任務及進度回報:

  • 應用於精神科個案之OT評估測驗之整理
    • 電腦化測驗之連結
    • 紙本測驗之表單
    • 各測驗之使用手冊(Deadline5/31)
      • 與SCL、GHL確認羅序分數、信度、T分數及量尺分數之意義及撰寫剩餘3個測驗之計分方式及分數解讀。
      • C-DVT校對
      • T-SDMT撰寫(分配給YTC,請他使用目前之格式補充之前沒寫之處)
      • CAT-SK撰寫(YTC已回傳,彙整心理計量特性中,今日進度60%)
      • CAT-FER撰寫
      • COTIME撰寫(彙整心理計量特性中,今日進度60%)
  • ABC-ML重新審視是否需要重跑分析及撰寫稿件之修改
  • 桃療期中報告撰寫
  • 桃療IRB修改後請唐主任送件(確認所有文件無誤後將請唐主任送件)
  • 台大中風AI送出變更案(請YTC抽換相關文字及確認是否有其他錯字後,已送件)
  • 安排WJS之Python課程(本周末安排完成)

[遠距上班日報]20210528上班

 今日預計任務:

  • 應用於精神科個案之OT評估測驗之整理
    • 電腦化測驗之連結
    • 紙本測驗之表單
    • 各測驗之使用手冊(預計5/28完成,最晚Deadline5/31)
      • 今日重新確認後,發現T-SDMT有部分內容未撰寫到,且C-DVT有部分需要進行補充
      • 任務分配:YTC進行格式修改、製作施測流程及貼上citation,指導語、計分方式、心裡計量特性彙整及測驗內容簡介由我撰寫
      • C-DVT校對(確認是否有需要修改或是補充處,今日進度0%)
      • T-SDMT撰寫(分配給YTC,請他使用目前之格式補充之前沒寫之處,)
      • CAT-SK撰寫(做完初稿後分配給YTC,需向SCL學長確認計分方式,今日進度30%)
      • CAT-FER撰寫(今日進度80%,需向SCL學長確認計分方式及彙整心裡計量特性)
      • COTIME撰寫(目前有半成品,需向SCL學長確認計分方式及彙整心裡計量特性)
  • ABC-ML重新審視是否需要重跑分析及撰寫稿件之修改
  • 桃療期中報告撰寫
  • 台大中風AI修正同意書未提到施測者費用之錯誤
  • 安排WJS之Python課程

2021年5月27日 星期四

[遠距上班日報]20210527下班

今日任務及進度回報:

  • 應用於精神科個案之OT評估測驗之整理
    • 電腦化測驗之連結
    • 紙本測驗之表單
    • 各測驗之使用手冊(預計5/28完成,最晚Deadline5/31)
      • 今日重新確認後,發現T-SDMT有部分內容未撰寫到,且C-DVT有部分需要進行補充
      • 任務分配:YTC進行格式修改、製作施測流程及貼上citation,指導語、計分方式、心裡計量特性彙整及測驗內容簡介由我撰寫
      • C-DVT校對(確認是否有需要修改或是補充處,今日進度0%)
      • T-SDMT撰寫(分配給YTC,請他使用目前之格式補充之前沒寫之處,)
      • CAT-SK撰寫(做完初稿後分配給YTC,需向SCL學長確認計分方式,今日進度30%)
      • CAT-FER撰寫(今日進度80%,需向SCL學長確認計分方式及彙整心裡計量特性)
      • COTIME撰寫(目前有半成品,需向SCL學長確認計分方式及彙整心裡計量特性)
  • ABC-ML重新審視是否需要重跑分析及撰寫稿件之修改
  • 桃療IRB追蹤
  • 桃療期中報告撰寫
  • 台大中風AI修正同意書未提到施測者費用之錯誤
  • 安排WJS之Python課程

[遠距上班日報]20210527上班

 今日預計任務:

  • 應用於精神科個案之OT評估測驗之整理
    • 電腦化測驗之連結
    • 紙本測驗之表單
    • 各測驗之使用手冊(預計5/28完成,最晚Deadline5/31)
  • ABC-ML重新審視是否需要重跑分析及撰寫稿件之修改
  • 桃療IRB追蹤
  • 桃療期中報告撰寫
  • 台大中風AI修正同意書未提到施測者費用之錯誤
  • 安排WJS之Python課程

2021年5月26日 星期三

[遠距上班日報]20210526下班

今日任務及進度回報:

  • 期中報告資料整理及撰寫:
    • 跑各個向度之R-square
      • 解決方式:將5個分數獨立,分別訓練模型後report R-square,並且修改相關之表格
    • 增加結果各次標題之撰寫內容
    • 討論與結論獨立撰寫,使之符合論文之架構
    • 補上重點之citation
  • 與謝老師定期討論
  • 應用於精神科個案之OT評估測驗之整理
    • 電腦化測驗之連結
    • 紙本測驗之表單
    • 各測驗之使用手冊(預計5/28完成,最晚Deadline5/31)
  • ABC-ML重新審視是否需要重跑分析及撰寫稿件之修改
  • 桃療IRB追蹤
  • 桃療期中報告撰寫
  • 台大中風AI修正同意書未提到施測者費用之錯誤
  • 安排WJS之Python課程

其他紀錄

學姊分享了高雄市政府如何應用Notion做出網頁,我認為可做為日後製作資料庫之參考

之前我只有研究到怎麼建造資料庫,並且讓各資料庫在不同頁面進行連結,但是尚未實際進行過,若有時間可以研究看看

[遠距上班日報]20210526上班

 今日預計任務:

  • 期中報告資料整理及撰寫(Deadline明日早上):
    • 跑各個向度之R-square(資料分析,進行中,50%)
      • 解決方式:將5個分數獨立,分別訓練模型後report R-square,並且修改相關之表格
    • 增加結果各次標題之撰寫內容(寫作原則,進行中,50%)
    • 討論與結論獨立撰寫,使之符合論文之架構(寫作原則,進行中,50%)
    • 補上重點之citation
  • 與謝老師定期討論
  • ABC-ML重新審視是否需要重跑分析及撰寫稿件之修改
  • 桃療IRB追蹤
  • 桃療期中報告撰寫

2021年5月25日 星期二

[遠距上班日報]20210525下班

  • 期中報告資料整理及撰寫(Deadline明日早上):
    • 簡化第二階段之文字
    • 結果部分與學長確認後,如果欲預測的分數為5個向度的話,應該要有5個R-square,但是目前我只有一個R-square,理由是因為我將所有資料直接餵入模型,因此模型給的是5個R-square的平均值。(資料分析,進行中,50%)
      • 解決方式:將5個分數獨立,分別訓練模型後report R-square,並且修改相關之表格
    • 調整結果之呈現方式,使初步結果之各次標題與方法相同,並將方法相關之敘述撰寫於對應之次標題內,並增加內容(寫作原則,進行中,50%)
    • 討論與結論獨立撰寫,使之符合論文之架構(寫作原則,進行中,50%)
    • 補上重點之citation
  • 與GHL學長之討論紀錄(目前有些想法,但是需與老師確認,預計明日固定時間討論時與老師確認):
    1. 期中報告結束後AI-stroke資料分析之規劃(此部分要跟老師確認老師之想法),目前我的想法如下:
      • 優化AI模型之分析方法(以本次使用之方法為基礎,優化分析方式,為了促使每周有固定進度,擬與學長進行每周或每2周之固定討論)
      • 為之後資料分析之自動化進行規劃
        1. 將各個動作片段切出來
        2. 撰寫資料分析相關之code
        3. 進行評估時增加相關應對方法減少非相關人員入鏡之機會
    2. 因應目前無法收案之情況,我認為是一個可以好好處理目前我們收案資料之機會,並且可藉這次探索AI-stroke分析之經驗,設計明確目的及內容之任務,並進行任務之分工。
  • ABC-ML重新審視是否需要重跑分析及撰寫稿件之修改
  • 桃療IRB追蹤
  • 桃療期中報告撰寫

[遠距上班日報]20210525上班

 今日預計任務:

  1. 期中報告資料整理及撰寫(結果撰寫):
    • 簡化第二階段之文字
    • 確認初步結果若要整理成表格是否需要加入其他數值
    • 之後的呈現可能可將不同向度分開訓練模型,則可整理成內容較為豐富之表格
  2. 13:30與GHL學長討論本次Openpose分析遇到之困難及之後之改善方向,欲討論之重點有二:
    1. 本次Openpose分析是否有需要改進之處,邏輯是否正確
    2. 之後優化之方向為何(收案上、資料分析上、影片上)
  3. ABC-ML重新審視是否需要重跑分析及撰寫稿件之修改
  4. 桃療IRB追蹤
  5. 桃療期中報告撰寫

[紀錄]之後進行Openpose分析可能會遇到的問題及可能之解法

(須找學長討論可行性,及與老師討論實行之必要性)

  • 目前的分析方法:將擷取出來的22個完成動作的畫面,標記出各動作開始及動作結束後,將二個畫面的25個標記點的數值相減,獲得(16,50)個數值
  • 因為SKlearn只能餵入至多2維的數組,因此我將每位個案的(5,16,50)(5位個案,每個個案有16個動作,每個動作有各25個X,Y座標)reshape成(5,800)(每位個案有800個座標點)
  • 用這個800個座標點去預測ML-5F五個向度的分數

因為後來我沒有將重點的動作擷取出來,因為後來發現這樣可能會十分費時。

然而,目前我的作法好像會有致命缺點,即是大部分的動作都沒有進行改變,因此這樣的預測結果可能是高估AI模型的預測能力的。

然而,目前我的資料裡面沒有整理個案患側的資料,且我也還沒想好以怎麼樣的判斷式去判斷個案的患側。但幸好本次納入分析的5人患側皆為左側。

之後如果要進行分析的話,必須要將個案患側的參數也納入,用來自動化判斷個案患側手

2021年5月24日 星期一

[遠距上班日報]20210524下班

今日任務及進度回報:

  1. 期中報告資料整理及撰寫(結果撰寫):已完成分析及撰寫初稿完成並傳給老師,預計明日會議時與老師討論。
  2. 晚點將整理本次Openpose分析時遇到之問題,預計明日下午與GHL學長討論,欲討論之重點有二:
    1. 本次Openpose分析是否有需要改進之處,邏輯是否正確
    2. 之後優化之方向為何(收案上、資料分析上)

[遠距上班日報]20210524上班

 今日預計任務:

  1. 期中報告資料整理及撰寫(結果撰寫)
    • 分析結果確認
      • 已擷取5位個案之Openpose之資料並確保資料之正確性,預計今日完成分析並完成撰寫
    • 分析結果撰寫
      • 預計將初步分析之ML模型預測力以淺顯易懂之方式呈現(目前尚未知道ML模型訓練出來之結果是否如預期可有良好之預測力,若預測力不佳,可能要找老師或學長討論)
      • 我預計中午前跑完分析結果,若有問題提前提出