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2019年7月30日 星期二

[文獻閱讀]Machine Learning-Based Model for Prediction of Outcomes in Acute Stroke.


研究目的:
比較不同分析模型預測急性中風患者long-term outcome之間的差異。本研究使用machine learning (ML)的運算模型,希望能提升急性中風患者long-term outcome的預測能力。

方法:
本研究使用了ML的三種運算法和傳統的分析方式,比較使用ML是否會比傳統的預測模型更具效能
研究者使用了2種不同的預測模型:(1) 納入所有資料的變項;(2) 僅納入包含在ASTRAL量表中的6個變項。此兩種預測模型利用ML的三種運算法:(1) deep neural network; (2)random forest; (3)regressionASTRAL量表的預測模型做比較。

結果:
結果顯示在納入所有變項的預測模型中,deep neural network的分析法比其他兩種運算法及ASTRAL量表能更有效預測急性中風患者得預後。由ROC curve的圖形來看,ROC曲線下的面積,deep neural networkASTRAL量表更具預測能力,並達到統計顯著[0.888 for deep neural network; 0.839 for ASTRAL scale]。然而,random forestregression的運算法雖然比ASTRAL量表有較好的預測能力,但未達統計顯著[0.857 for random forest; 0.849 for logistic regression]
在納入6個變項的預測模型中,3ML運算法雖然都比ASTRAL量表有稍好的預測能力,但皆未達統計顯著[0.853 for deep neural network; 0.828 for random forest; 0.846 for logistic regression]

討論:
本研究發現使用ML運算法相較ASTRAL量表,更能提升預測急性中風患者long-term outcome的預測能力。三種運算法中,deep neural network的預測效能在納入所有變項及6ASTRAL的變項時,顯著比其他兩種運算法及ASTRAL更好。所以deep neural network可能是最適合來預測long-term outcome的運算法。

限制:
本研究為單一機構收案,所使用的變項是該機構所使用的評估變項。研究結果可能受到不同機構使用不同評估變項影響。





2019年2月1日 星期五

2018.09.20~2019.02.01總整理(20190201持續更新)


英文
準備英文口頭報告SOP
l   理解並掌握欲報告之主要概念
l   報告前撰寫講稿,並且給LYNN確認英文文法
l   PPT製作時呈現重點,可使用圖表輔助講解
困難及問題(藍色)/解決方法(橘紅色)
l   理解概念需要先將英文翻成中文,之後再將理解之中文翻回英文確認意思。可嘗試看完文獻後直接用英文寫出本段重點,之後再彙整每段之重點。
l   沒有撰寫講稿之習慣,或事前未規劃足夠之時間準備。養成每周以英文簡短彙整一篇文獻 (前言部分)
l   準備PPT時(以文獻報告為例),會習慣將該文獻之第一段每一段落都做成一張PPT應該先將概念理解之後,重新排列組合,以凸顯重點。
寫作自我檢核
整體
l   前後是否呼應
l   主題、研究目的、內文是否呼應
l   如果自己不確定是否有寫好(如重要性),可先檢查自己那些文字有提到
段落層級
l   主題句是否凸顯主旨、段落主題
l   是否有結論句
l   結論句是否與之前過多重覆
l   是否包含過多意思相近之名詞
句子層級
l   主詞、動詞是否明確

閱讀文章
單字無法藉由查字典理解
l   整本書/文章前後文是否有提過,或是否有該文字之定義
l   找該作者其他相關文獻之解釋,或其他該領域之學者如何解釋
l   不確定之段落不要自行腦補解釋,應根據白紙黑字理解

分析方法
SPSS統計分析SOP
l   前置:點確定之前都先點"貼上之後",保留語法
l   確認資料是否有遺漏
l   確認資料之正確性/完整性 (頻率分析)-天花板/地板效應
l   確認資料之分配型態 (描述性統計)-Mean/SD/偏態/峰度
l   遺漏值之補救(是否插補與老師/團隊討論,基本不插補)
l   再測信度(兩兩跑ICC,記得設定ICC model)
l   如果有再測,pool所有評估的時間,然後算MD/SD(SD只能EXCEL彙整之後求出)
l   pair t-testdifference of MDSD及顯著等級
l   SEM/MDC/effect size之計算(EXCEL寫公式求出)
l   確認誤差異質性 (資料點絕對值後計算相關係數)
l   同時效度/收斂效度/生態效度 (評估工具之間之相關係數)
l   確認重點指標 (表格呈現時之取捨)

概念釐清
1.      評估工具測量到之概念無共識/目前研究對於某一概念無共識(如ToM
l   彙整目前研究常用之概念為何
l   該研究領域主要研究者寫出來之概念為何
2.      欲分析之項目過多如何判斷?
l   作者採用之計分方法
l   確認標準計分方式
l   確認目前常用之計分方式

 自己應該還有更多不足之部分,想到的話會再更新

2017年8月29日 星期二

[LOTCA-II]中風組與腦部外傷組心理計量特性整理(碩論)

蔡佳殷. (2005). 洛文斯坦認知評估第二版國內信效度之檢驗:中風與頭部外傷病患. 高雄醫學大學, Available from Airiti AiritiLibrary database. (2005)

信度

中風組
頭部外傷組
內部一致性
Cronbach’s α
α = 0.908
(n=31)
α = 0.942
(n=33)
再測信度
Pearson r
r = 0.949
(n=22)
r = 0.984
(n=20)
施測者間信度
Pearson r
r = 0.994
(n=20)
r = 0.999
(n=20)

效度

中風組
頭部外傷組
同時效度
Pearson r
(n=20)
LOTCA-II總分與WAIS-III各分量表有中至高度相關(r= .56~ .84)WAIS-III總量表與LOTCA-II總分有中度相關(r= .70)
LOTCA-II總分與MMSE總分有中度相關(r= .693)
LOTCA-II總分與TVPS總分有低到中度相關(r= .47~ .78)
LOTCA-II總分與WCST總分有低到中度相關(r= .46~ .50)
LOTCA-II總分與BVRT總分有中度相關(r= .685)
(n=20)
LOTCA-II總分與WAIS-III各分量表有低至中度相關(r= .32~ .76)WAIS-III總量表與LOTCA-II總分有中度相關(r= .61)
LOTCA-II總分與MMSE總分有中度相關(r= .812)
LOTCA-II總分與TVPS總分有低到中度相關(r= .49~ .83)
LOTCA-II總分與WCST總分有低到中度相關(r= .46~ .62)
LOTCA-II總分與BVRT總分有中度相關(r= .65)
區辨效度
MANOVA
(n=31)
中風組與正常組之比較,區別正確率為66.1%,中風組正確預測率為58.1%,正常組的正確預測率為67.2%
(n=33)
頭部外傷組與正常組之比較,區別正確率為78.1%,頭部外傷組正確預測率為63.6%,正常組的正確預測率為93.5%

建構效度:使用EFA因素分析,分析結果顯示可由一共同因素解釋變異量為66.96%

2017年7月24日 星期一

[文獻回顧]LOTCA-II因素分析

Q: 作者所提到的Aera是指什麼?

A:
作者提到的Area是作者使用了Parcel的方法後的產物。此篇研究作者使用CFA驗證LOTCA-II的模型適配度,在Model II作者使用了Parcel的方法,其目的為可提升模型之適配度,且需要估計的參數會減少,所需樣本數也會下降。
Model II的模型架構為:LOTCA-II是包含兩個層面的認知領域(Area),分別為perceptual memory/ praxis(低負載的認知知覺技能)constructional/ conceptual function(高負載的認知知覺技能)LOTCA-II的所有分量表都是對應到這兩個構念,perceptual memory/ praxis1包含Orientation Visual PerceptionMotor Praxisconstructional/ conceptual function包含Thinking Operations areaVisuospatial Organization Area。高負載認知技巧使用Parcel的方法,Thinking Operations areaVisuospatial Organization Area對應的分量表的分數計算方式為融合Visuomotor OrganizationSpatial Perception的分數,因為Spatial Perception在此模型中,被認為是一個constructional/ conceptual functioncomponent


Q: 作者這樣的做法的合理性與是否納入此篇研究進入LOTCA-II文獻回顧的練習寫作?

A;

因作者使用的方法學(如使用Parcel的理由)不太適合,如果今天是要寫回顧文獻的論文,可以在討論的部分探討作者方法學上的問題,但是在研究方法的部份也必須列出以什麼樣的標準評斷文章的品質。這部份學長姊有讓我看一篇專門寫系統性回顧的資料庫,他們會使用紅綠燈的方式評析論文的優劣,也會寫出評斷標準。