[機器學習]使用Colab的心得（更新Colab可使用時間）

最近嘗試使用Colab來分析AI-DVT的資料，結果發現Google是有限制GPU的分析用量的。之前還在查詢是否有其他解法，但今天有幸聽到「深度學習於電腦視覺」的課程內容提到分析的軟硬體的比較，如果要增加用量只能付費，但是價格不便宜。

20211004更新：Google colab每使用12hr會reset一次，連續使用約一周會被暫停使用GPU 24hr

以現在的分析量來說，一個Gsuite帳號一天大概可以分析一位個案的資料，所以如果需要分析完目前的91為個案的話，如果要縮短分析的時間，可能要使用不同的帳號來分析。
幸好分析的部分可以分開寫code，所以操作上並不會太困難。

關於AI-DVT，目前正在檢查資料的過程中，我認為應該可以使用眼睛的部分跟嘴巴的部分當作判斷依據。
但是我剛剛有發現一些錯誤，詳細如下：

1. 眼睛的部分因為個案一開始的時候可能不熟悉，所以有些個案會先看鍵盤再作答，而這樣的動作可能會影響判斷

2. 嘴巴的部分，是我在評估時，有些個案會邊做邊講話，而依據我的理解，這個動作應屬於分心的動作，且Openpose可判斷出來

但是我覺得這樣的數據仍然太少，依照目前的拍攝方法，Openpose好像沒有辦法抓到受測者的肢體動作。

目前我預計只抓取眼睛跟嘴巴的數據當作分析資料，其他資料不納入分析

這部分還要跟學長們討論看看，目前就依照現在已經標記的個案跑初步結果，並嘗試跑模型，看看預測結果如何。

[研究核心能力]2021八大核心能力自評_博士班學生入學

 

[英文]Lynn Comments及後續改善方向

之前自己的回顧

[學習回顧][英文]英文課程回顧及檢討（回顧最近一年安排之內容）

Lynn Comments

• Edit manuscripts
• Read and discuss journal articles

Pei Chi is a hardworking student who is serious about improving her English ability. Her reading skills have improved a lot. She now reads much more fluently and can sound out new words herself. She still needs to be more careful of similar words e.g. contrast/construct, psychology/physiology, as using the wrong word can easily lead to misunderstanding. She should also try to work on pauses and intonation when she reads, as well as noting syllable stress. This requires practice by looking ahead of what you are reading, not just focusing on the word in front of you. In her writing, there are still some basic grammar mistakes such as with the use of singular/plural nouns, adjectives/adverbs, there is/are. She needs to practice elongating her sentences by using connectives and participles. The subject of the sentences are sometimes unclear and more description is needed. Building vocabulary is also important and she should make note of them in a glossary and try to use them in her writing.

改善方向

• 聽：目前暫無相關練習，但我認為可安排AI相關之演講，聽完後和Lynn討論；或是非上課時間時自行聽英文演講。
• 說：仍以AI相關的文獻為主，增進口說能力及為AI相關主題之英文報告做準備。
• 讀：仍以AI相關的文獻為主，與文獻閱讀一起增強。
• 寫：與寫作課並進，在寫作課前與Lynn討論，寫作課後修改再給Lynn看。

[上班日報]20210903進度回報

今日任務及進度回報：

•  助理AI收案相關事宜彙整及處理
  •  確認復健部、精神部收案流程
•  ABC-ML稿件確認內容後再傳給老師（修改中）
• 統計大家可以進行寫作課的時間（9/10期限，統計時間中）
• AI-DVT收案
  • 收案影片檔名重新命名並整理（本日完成20人，共完成50人）
  • 後續分析及結案報告撰寫規劃（code研究中）
  • 確認AI-DVT之影片品質：使用Openpose標註各影片之臉部標記點，並確認標記之品質。若品質不如預期，則可能可於再測時進行補拍。（執行人員：PCL，要再估算完成任務所需時間，嘗試使用CoLab之Openpose之自動化的撰寫）
• 二本新原文書驗收
• 閱讀 "Assessment in Health Professions Education"中關於心理計量特性之章節（Reability）
• 協助桃療治療師研究案撰寫相關之諮詢
•  中風AI之後之資料處理：
  •   以一小段影片測試影片畫面切割及流程順序是否影響影片品質（執行人員：PCL，預計6/2開始執行）。
  •  查找影片處理之相關技術如何實現（執行人員：PCL，搜尋是否有其他人有相關經驗）
  •  以程式語言剪輯影片，將各動作切成小影片片段（預計執行人員：PCL，可先撰寫code，使用現成之檔案測試，預計6/2後進行）。
  •  切割完畢後分類各個影片，並以codename的方式標記每個動作，使每個影片都有固定之檔案名稱，以利之後進行自動化分析。（預計執行人員：PCL，於剪輯影片時完成，設計對應之規則以利自動化，預計6/2後進行）
  •  確認於Python開啟powershell並執行之方法，原理：用Python開啟powershell，然後再讓powershell讀取我們寫好的檔案。（執行人員：PCL，需要查找相關資料及執行方法）
  •  判斷個案患側，以確認個案於畫面中之位置（執行人員：PCL，可先寫code）
•  安排WJS之Python課程
  • 下次上課時間：8/7WJS有事，8/14PCL有事，因此這兩週放假，下次上課時間8/21
  •  確認課程內容
    •  8/21：重新考慮課程內容，並與學長討論
• 台大IRB
  • 小兒AI持續審查及試驗偏差案追蹤（追蹤中）
  • 小兒AI變更案（追蹤中）
  • 小兒AI新案（待CYH老師獲得台大醫院帳號後申請）
• 榮總IRB後續處理（追蹤）

AI收案人數彙整：(2021/8/27)

機構 & 計畫	收案人員	完成第一次施測	完成第二次施測	流失人數	總計
台大/中風AI	YTC、PCL	19	-	4(影片遺失*)	15
榮總/中風AI	YTC、PCL	4	-	0	4
台大/認知AI	尚未開始收案	-	-	-	-
桃療/AI-DVT	YTC（第一次）、 PCL（第二次）	97	81	9（出院）+2（拒絕）	81
桃療/認知AI	尚未開始收案	-	-	-	-

＊4位影片檔遺失之個案目前仍在尋找是否可能存於舊電腦中

IRB追蹤：(2021/8/12)

機構	計劃案名稱	IRB狀態	負責人	下一階段
台大	發展人工智慧於中風患者及 發展遲緩兒童之動作、 注意力以及情緒評估系統	持續審查、變更案 送審中	PCL＊	1. 持續審查案、試驗偏差案追蹤（8/9） 2. 變更案8送出，追蹤中
台大	發展中風患者動作、平衡及 行走能力之人工智慧評估系統	變更案 通過	PCL＊	-
台大	應用於思覺失調症患者之 人工智慧認知評估系統之 發展及驗證	新案通過	PCL＊	待收案，目前缺收案人員前往收案
榮總	發展中風患者動作、平衡及 行走能力之人工智慧評估系統	變更案通過	YCC＊	準備進行持續審查，已將所需文件準備好給YCC，待YCC通知
凱旋	思覺失調症同步二階層認知 功能篩檢＆AICS 發展	新案送審中	YCC＊	暫緩，待目前凱旋之計畫結束後再討論
桃療	發展人工智慧輔助之 持續性注意力測驗	新案通過	YCC＊	已開始收案
桃療	應用於思覺失調症患者之人工智慧 認知評估系統之發展及驗證	新案送審中	PCL＊	第一次回覆送出，待追蹤

＊YJS: Yun Jer Shieh; PCL: Pei Chi Li; YTC: Yu Tzu Chen; YCC: Yu Chien Chang

[桃療遠距上班日報]20210902進度回報

今日任務及進度回報：

•  助理AI收案相關事宜彙整及處理
  •  確認復健部、精神部收案流程
  •  協助助理紅卡申請
•  ABC-ML稿件確認內容後再傳給老師（修改中）
• 統計大家可以進行寫作課的時間（9/10期限，統計時間中）
• AI-DVT收案
  • 收案影片檔名重新命名並整理（本日完成20人，共完成50人）
  • 後續分析及結案報告撰寫規劃
  • 確認AI-DVT之影片品質：使用Openpose標註各影片之臉部標記點，並確認標記之品質。若品質不如預期，則可能可於再測時進行補拍。（執行人員：PCL，要再估算完成任務所需時間，嘗試使用CoLab之Openpose之自動化的撰寫）
• 協助桃療治療師研究案撰寫相關之諮詢
•  中風AI之後之資料處理：
  •   以一小段影片測試影片畫面切割及流程順序是否影響影片品質（執行人員：PCL，預計6/2開始執行）。
  •  查找影片處理之相關技術如何實現（執行人員：PCL，搜尋是否有其他人有相關經驗）
  •  以程式語言剪輯影片，將各動作切成小影片片段（預計執行人員：PCL，可先撰寫code，使用現成之檔案測試，預計6/2後進行）。
  •  切割完畢後分類各個影片，並以codename的方式標記每個動作，使每個影片都有固定之檔案名稱，以利之後進行自動化分析。（預計執行人員：PCL，於剪輯影片時完成，設計對應之規則以利自動化，預計6/2後進行）
  •  確認於Python開啟powershell並執行之方法，原理：用Python開啟powershell，然後再讓powershell讀取我們寫好的檔案。（執行人員：PCL，需要查找相關資料及執行方法）
  •  判斷個案患側，以確認個案於畫面中之位置（執行人員：PCL，可先寫code）
•  安排WJS之Python課程
  • 下次上課時間：8/7WJS有事，8/14PCL有事，因此這兩週放假，下次上課時間8/21
  •  確認課程內容
    •  8/21：重新考慮課程內容，並與學長討論
• 台大IRB
  • 小兒AI持續審查及試驗偏差案追蹤（追蹤中）
  • 小兒AI變更案（追蹤中）
  • 小兒AI新案（待CYH老師獲得台大醫院帳號後申請）
• 榮總IRB後續處理（追蹤）

AI收案人數彙整：(2021/8/27)

機構 & 計畫	收案人員	完成第一次施測	完成第二次施測	流失人數	總計
台大/中風AI	YTC、PCL	19	-	4(影片遺失*)	15
榮總/中風AI	YTC、PCL	4	-	0	4
台大/認知AI	尚未開始收案	-	-	-	-
桃療/AI-DVT	YTC（第一次）、 PCL（第二次）	97	81	9（出院）+2（拒絕）	81
桃療/認知AI	尚未開始收案	-	-	-	-

＊4位影片檔遺失之個案目前仍在尋找是否可能存於舊電腦中

IRB追蹤：(2021/8/12)

機構	計劃案名稱	IRB狀態	負責人	下一階段
台大	發展人工智慧於中風患者及 發展遲緩兒童之動作、 注意力以及情緒評估系統	持續審查、變更案 送審中	PCL＊	1. 持續審查案、試驗偏差案追蹤（8/9） 2. 變更案8送出，追蹤中
台大	發展中風患者動作、平衡及 行走能力之人工智慧評估系統	變更案 通過	PCL＊	-
台大	應用於思覺失調症患者之 人工智慧認知評估系統之 發展及驗證	新案通過	PCL＊	待收案，目前缺收案人員前往收案
榮總	發展中風患者動作、平衡及 行走能力之人工智慧評估系統	變更案通過	YCC＊	準備進行持續審查，已將所需文件準備好給YCC，待YCC通知
凱旋	思覺失調症同步二階層認知 功能篩檢＆AICS 發展	新案送審中	YCC＊	暫緩，待目前凱旋之計畫結束後再討論
桃療	發展人工智慧輔助之 持續性注意力測驗	新案通過	YCC＊	已開始收案
桃療	應用於思覺失調症患者之人工智慧 認知評估系統之發展及驗證	新案送審中	PCL＊	第一次回覆送出，待追蹤

＊YJS: Yun Jer Shieh; PCL: Pei Chi Li; YTC: Yu Tzu Chen; YCC: Yu Chien Chang

[桃療遠距上班日報]20210901進度回報

今日任務及進度回報：

•  學會研討會投稿（「發展中風病人AI短版STREAM動作評估表」，9/15截止）
•  助理AI收案相關事宜彙整及處理
  •  確認復健部、精神部收案流程
  •  協助助理紅卡申請
•  ABC-ML稿件確認內容後再傳給老師（修改中）
• 統計大家可以進行寫作課的時間（9/10期限，統計時間中）
• AI-DVT收案
  • 收案影片檔名重新命名並整理（目前完成10人，共完成10人）
• 協助桃療治療師研究案撰寫相關之諮詢
• 確認AI-DVT之影片品質：使用Openpose標註各影片之臉部標記點，並確認標記之品質。若品質不如預期，則可能可於再測時進行補拍。（執行人員：PCL，要再估算完成任務所需時間，嘗試使用CoLab之Openpose之自動化的撰寫）
•  中風AI之後之資料處理：
  •   以一小段影片測試影片畫面切割及流程順序是否影響影片品質（執行人員：PCL，預計6/2開始執行）。
  •  查找影片處理之相關技術如何實現（執行人員：PCL，搜尋是否有其他人有相關經驗）
  •  以程式語言剪輯影片，將各動作切成小影片片段（預計執行人員：PCL，可先撰寫code，使用現成之檔案測試，預計6/2後進行）。
  •  切割完畢後分類各個影片，並以codename的方式標記每個動作，使每個影片都有固定之檔案名稱，以利之後進行自動化分析。（預計執行人員：PCL，於剪輯影片時完成，設計對應之規則以利自動化，預計6/2後進行）
  •  確認於Python開啟powershell並執行之方法，原理：用Python開啟powershell，然後再讓powershell讀取我們寫好的檔案。（執行人員：PCL，需要查找相關資料及執行方法）
  •  判斷個案患側，以確認個案於畫面中之位置（執行人員：PCL，可先寫code）
•  安排WJS之Python課程
  • 下次上課時間：8/7WJS有事，8/14PCL有事，因此這兩週放假，下次上課時間8/21
  •  確認課程內容
    •  8/21：重新考慮課程內容，並與學長討論
• 台大IRB
  • 小兒AI持續審查及試驗偏差案追蹤（追蹤中）
  • 小兒AI變更案（追蹤中）
  • 小兒AI新案（待CYH老師獲得台大醫院帳號後申請）
• 榮總IRB後續處理（追蹤）

AI收案人數彙整：(2021/8/27)

機構 & 計畫	收案人員	完成第一次施測	完成第二次施測	流失人數	總計
台大/中風AI	YTC、PCL	19	-	4(影片遺失*)	15
榮總/中風AI	YTC、PCL	4	-	0	4
台大/認知AI	尚未開始收案	-	-	-	-
桃療/AI-DVT	YTC（第一次）、 PCL（第二次）	97	81	9（出院）+2（拒絕）	81
桃療/認知AI	尚未開始收案	-	-	-	-

＊4位影片檔遺失之個案目前仍在尋找是否可能存於舊電腦中

IRB追蹤：(2021/8/12)

機構	計劃案名稱	IRB狀態	負責人	下一階段
台大	發展人工智慧於中風患者及 發展遲緩兒童之動作、 注意力以及情緒評估系統	持續審查、變更案 送審中	PCL＊	1. 持續審查案、試驗偏差案追蹤（8/9） 2. 變更案8送出，追蹤中
台大	發展中風患者動作、平衡及 行走能力之人工智慧評估系統	變更案 通過	PCL＊	-
台大	應用於思覺失調症患者之 人工智慧認知評估系統之 發展及驗證	新案通過	PCL＊	待收案，目前缺收案人員前往收案
榮總	發展中風患者動作、平衡及 行走能力之人工智慧評估系統	變更案通過	YCC＊	準備進行持續審查，已將所需文件準備好給YCC，待YCC通知
凱旋	思覺失調症同步二階層認知 功能篩檢＆AICS 發展	新案送審中	YCC＊	暫緩，待目前凱旋之計畫結束後再討論
桃療	發展人工智慧輔助之 持續性注意力測驗	新案通過	YCC＊	已開始收案
桃療	應用於思覺失調症患者之人工智慧 認知評估系統之發展及驗證	新案送審中	PCL＊	第一次回覆送出，待追蹤

＊YJS: Yun Jer Shieh; PCL: Pei Chi Li; YTC: Yu Tzu Chen; YCC: Yu Chien Chang

[桃療遠距上班日報]20210831進度回報

今日任務及進度回報：

•  安排博班三年要修的課程（統計、AI、主要領域，已決定這學期的課程）
•  學會研討會投稿（「發展中風病人AI短版STREAM動作評估表」，9/15截止）
  •  再次確認數據並修改摘要（修改中）
•  助理AI收案相關事宜彙整及處理
  •  收案流程SOP整理
•  ABC-ML稿件確認內容後再傳給老師（修改中）
• 統計大家可以進行寫作課的時間（9/10期限，已向老師確認寫作課名單，統計時間中）
• AI-DVT收案
  • 收案資料登錄（目前登錄PSP資料，目前完成30人，共完成85人）
  • 收案影片檔名重新命名並整理
• 協助桃療治療師研究案撰寫相關之諮詢
• 確認AI-DVT之影片品質：使用Openpose標註各影片之臉部標記點，並確認標記之品質。若品質不如預期，則可能可於再測時進行補拍。（執行人員：PCL，要再估算完成任務所需時間，嘗試使用CoLab之Openpose之自動化的撰寫）
•  中風AI之後之資料處理：
  •   以一小段影片測試影片畫面切割及流程順序是否影響影片品質（執行人員：PCL，預計6/2開始執行）。
  •  查找影片處理之相關技術如何實現（執行人員：PCL，搜尋是否有其他人有相關經驗）
  •  以程式語言剪輯影片，將各動作切成小影片片段（預計執行人員：PCL，可先撰寫code，使用現成之檔案測試，預計6/2後進行）。
  •  切割完畢後分類各個影片，並以codename的方式標記每個動作，使每個影片都有固定之檔案名稱，以利之後進行自動化分析。（預計執行人員：PCL，於剪輯影片時完成，設計對應之規則以利自動化，預計6/2後進行）
  •  確認於Python開啟powershell並執行之方法，原理：用Python開啟powershell，然後再讓powershell讀取我們寫好的檔案。（執行人員：PCL，需要查找相關資料及執行方法）
  •  判斷個案患側，以確認個案於畫面中之位置（執行人員：PCL，可先寫code）
•  安排WJS之Python課程
  • 下次上課時間：8/7WJS有事，8/14PCL有事，因此這兩週放假，下次上課時間8/21
  •  確認課程內容
    •  8/21：重新考慮課程內容，並與學長討論
• 台大IRB
  • 小兒AI持續審查及試驗偏差案追蹤（追蹤中）
  • 小兒AI變更案（追蹤中）
  • 小兒AI新案（待CYH老師獲得台大醫院帳號後申請）
• 榮總IRB後續處理（追蹤）

AI收案人數彙整：(2021/8/27)

機構 & 計畫	收案人員	完成第一次施測	完成第二次施測	流失人數	總計
台大/中風AI	YTC、PCL	19	-	4(影片遺失*)	15
榮總/中風AI	YTC、PCL	4	-	0	4
台大/認知AI	尚未開始收案	-	-	-	-
桃療/AI-DVT	YTC（第一次）、 PCL（第二次）	97	81	9（出院）+2（拒絕）	81
桃療/認知AI	尚未開始收案	-	-	-	-

＊4位影片檔遺失之個案目前仍在尋找是否可能存於舊電腦中

IRB追蹤：(2021/8/12)

機構	計劃案名稱	IRB狀態	負責人	下一階段
台大	發展人工智慧於中風患者及 發展遲緩兒童之動作、 注意力以及情緒評估系統	持續審查、變更案 送審中	PCL＊	1. 持續審查案、試驗偏差案追蹤（8/9） 2. 變更案8送出，追蹤中
台大	發展中風患者動作、平衡及 行走能力之人工智慧評估系統	變更案 通過	PCL＊	-
台大	應用於思覺失調症患者之 人工智慧認知評估系統之 發展及驗證	新案通過	PCL＊	待收案，目前缺收案人員前往收案
榮總	發展中風患者動作、平衡及 行走能力之人工智慧評估系統	變更案通過	YCC＊	準備進行持續審查，已將所需文件準備好給YCC，待YCC通知
凱旋	思覺失調症同步二階層認知 功能篩檢＆AICS 發展	新案送審中	YCC＊	暫緩，待目前凱旋之計畫結束後再討論
桃療	發展人工智慧輔助之 持續性注意力測驗	新案通過	YCC＊	已開始收案
桃療	應用於思覺失調症患者之人工智慧 認知評估系統之發展及驗證	新案送審中	PCL＊	第一次回覆送出，待追蹤

＊YJS: Yun Jer Shieh; PCL: Pei Chi Li; YTC: Yu Tzu Chen; YCC: Yu Chien Chang