2020年6月9日 星期二

[AI]20200609會議紀錄


20200609會議紀錄
議題:AI任務釐清及分配
目的:釐清大家手上會的AI技術跟任務,及未來任務之分配

1.    短版AI分析目前排除恭宏後,沒有人可以獨立運作
 解決:目前多為概念上、方向上的釐清,可用遠端討論。
2.    AI動作上的分析(成人、小兒)的任務交接
l   分類:
²  成人以大動作為主
²  小兒動作較複雜
l   恭宏分類動作分析的標的
l   士捷彙整目前小兒的部分
l   方向:小兒跟成人分開寫,並寫後續可以擴展的領域
l   後續:一周後再討論(6/16 09:30
3.    AI小兒分析收案的後續:
l   這梯小兒收案後做第一次的分析
l   分析技術目前只有恭宏會,應考慮技術轉移
4.    AI成人分析收案的後續:
l   CAT-FES及動作評估,目前累積案量56位,暫時無法進行分析
l   目前由恭宏學長推動,收案由姿敏負責
l   老師將考慮後續任務由誰接任
5.    獲得SIS的大資料:(以AI優先,之後可考慮因素分析題材,避免二題材互相攻擊)
l   任務:
²  短版的AI技術套用
²  CFA驗證他的因素分析
ü   士捷調查跟思考SIS各版本組成之架構,以及驗證各版本SIS之架構
²  驗證因素效度(原始版、AI短版)
ü   病人填寫版
ü   代理人填寫版

2020年3月2日 星期一

[討論紀錄]20200227中風個案AIMAE收案後討論


議題:
l  人偶呈現的連續動作令個案難以記憶
l  有些動作需要治療師示範個案才能理解動作如何進行
結論:
l  使用真人拍攝之影片當作示範影片
l  編寫影片之新劇本
l  拍攝角度包含多個角度(正面、側面)
l  加入明確之指導語及各步驟之口令
l  確認指導語之用詞是否淺顯易懂
l  開始正式施測時給予一個明確的開始指令


2020年1月17日 星期五

[討論紀錄]20200116中風個案AIMAE收案後討論


20200116中風個案AIMAE收案後討論

1.   議題:攝影機放置處、治療師位置。
原本:攝影機置於健側,治療師位於患側以確保個案安全,但拍攝時置於患側,且可清楚拍攝到患側。
結論:攝影機置於個案患側邊,治療師位於個案患側後方
2.   議題:開始拍攝時是否需簡介。
原本:邀請時、說明同意書時有說明儀器設備,但沒說明攝影器材位置
結論:開始動作測驗的拍攝時(帶到拍攝評估地點時),需先向個案簡介鏡頭配置及螢幕配置
3.   議題:
l  較多動作連續時,個案無法記清動作
l  個案受到影片中人偶動作制約,想要與人偶動作一樣
l  個案做單一動作所花費的時間過久,或不知道動作什麼時候結束
原本:PPT中練習的那張PPT有放GIF圖片
結論:
l  刪除練習的那張PPT所放GIF圖片,改為各動作步驟之單字(方便記憶)。
l  個案健側練習時給予口語提示。
4.   議題:個案動作做錯時,是否可以重做。
原本:健側、患側動作各1次,平衡動作做2次。未設定是否可重做。
結論:
l  健側動作不限次數,但須確保個案了解動作。
l  患側動作做2次。平衡動作做2次。
l  患側動作及平衡動作沒做成功時,該次不算。
5.   議題:評估結束後可否給回饋
原本:未設定
結論:
l  評估中可給回饋。
l  結束後可給CAT-FAS成績回饋(百分等級)及整體回饋(由評估者依據個案狀況給予回饋)

2019年10月8日 星期二

[學習]2019.10.07學習進度


上周討論
1.        寫作原則
l  人工智慧簡介應先概括介紹[大結構],之後針對各個名詞做解釋[各分項],段落與段落之間應銜接(top-down)。
l  說明方法應將電機相關知識與生物科學連結,確保說明的面向可同時包含生物科學與電機之觀點。
2.        寫作課參與者可獲得之學習目的:製作寫作原則checklist,確認自己的checklist之通用性。
本周欲討論之議題
1.        人工智慧、機器學習、深度學習之概念釐清:
l  撰寫之內容是否與老師所認知的概念相似?
2.        寫作之checklist
[整體通用]
l  主題句、主旨是否明確,主題句與結論句是否前後呼應。
l  前一段落之結論句是否與下一段落之主題句/主旨呼應。
l  各段落不超過8
[前言][方法][結果][結論]待補充

2019年9月3日 星期二

[學習]2019.09.03本周任務及進度回報

本周任務
一、  製作9/6衛福部研討會之PPTCOWMEM)及海報(iSAT
(1)   COWMEMPPT完成PPT及預報
(2)   iSAT之海報完成且已送印
二、  選課:選上生物統計學二
三、  亞大論文獎勵之申請:已登錄完成,尚未印出申請單。
四、  本周無VISTA資料庫整理之進度

遇到之困難
一、  WM多系統模式概念釐清:釐清多系統模式中,四個系統差異為訊息收集來源的不同(聽覺及視覺),除了從環境中的刺激而來之外,也包含從長期記憶中提取及放回。

後續預計進行之任務
(1)   9/6衛服部研討會
(2)   建立ASTRAL model並比較與RFLrDNN之表現

2019年8月26日 星期一

[學習]2019.08.27欲討論之內容


本周任務
一、   VISTA資料庫
(1)   建立training機器學習Logistic regressionLr)及deep neural networkDNN)。
(2)   將資料分成train set/validation set/test set三組,分別訓練及驗證3種模型[Random ForestRF)、LrDNN]來預測90天後之MRS之分數。
(3)   使用train set訓練3種模型、validation set驗證3種模型,最後用test set繪製ROC curve。結果顯示DNN的表現最好(0.77),Lr的表現次之(0.76),RF的表現最差(0.73)。結果與Heo之研究 (Heo et al., 2019) 相同。繪製之ROC curve如下:


二、   製作9/6衛福部研討會之PPTCOWMEM)及海報(iSAT
(1)   COWMEMPPT完成大綱(有與學長討論)及部分初稿
(2)   iSAT之海報完成大綱
三、   選課:初選未選上統計,因此多選了生物統計學二

遇到之困難
一、   VISTA資料庫
(1)   建立training機器學習model時,不清楚各個modelpython code參數應該設定多少。
解決方法:先使用sklearn預設之數值,但run code時出現錯誤或結果無法完全複製Heo之研究(Heo et al., 2019)。確認該研究中是否有寫相關參數、確認code錯誤之原因並作調整。
(2)   machine learning的觀念釐清
解決方法(觀念釐清):
a.    over fitting(過度契合)是指匯入的training data過度契合訓練出來的model,主詞及受詞為modeltraining data,而非testing data。所以才會造成testing data匯入model時,產生的model表現差。
b.   資料分成train set/validation set/test set三組時,應使用train set訓練及調整模型、validation set驗證及選擇模型,最後使用test set確認模型之表現。理論上驗證模型與確認模型之模型表現結果不會差太多。切勿使用testing data調整模型。
二、   製作COWMEM研討會之PPT
(1)   PPT中關於工作記憶之定義、整體呈現之rationale及資料呈現之取捨有問題時皆找恭宏學長釐清。

後續預計進行之任務
(1)   建立ASTRAL model並比較與RFLrDNN之表現
(2)   8/28送印iSAT計畫之海報
(3)   8/30前找恭宏學長試報COWMEM計畫之PPT

參考資料
1.     Heo, J., Yoon, J. G., Park, H., Kim, Y. D., Nam, H. S., & Heo, J. H. (2019). Machine Learning-Based Model for Prediction of Outcomes in Acute Stroke. Stroke, 50(5), 1263-1265. doi:10.1161/strokeaha.118.024293


2019年8月19日 星期一

[學習]2019.08.20欲討論之內容


本周任務為
(1)  VISTA資料庫中選出ASTRAL使用到的之變項(共10個),轉換單位不統一之變項後處理缺失值。
(2)  建立training機器學習model 1(random forest)及繪製ROC curve。結果顯示model 1的表現為0.99,繪製之ROC curve如下:

(3)  將資料分成train set/validation set/test set三組,並呈現描述性統計、各預測變項與結果變項之相關性。

2019年8月14日 星期三

[學習]2019.08.13討論整理及口語表達問題檢討


口語表達問題檢討

1.     表達原則:重點越早呈現、越清楚越好
2.     結構化格式:任務內容→任務目的→過程→結果→解決方法(包含前因後果)
3.     討論前一天前將本周要討論之議題依照上述之結構PO部落格

2019年7月30日 星期二

[VISTA]20190730


VISTA資料處理:

目的:
1.    熟悉用Python整理資料
2.    Python使用machine learning的分析模型預測中風患者的預後的效果,並與傳統的迴歸分析的效能做比較

目前遇到的困難及處理:
1.    missing data刪掉,第一次刪除missing data時,還是會有一些資料空白,python沒有將它刪掉。後來發現是原始資料內有空格,然後我對coding不清楚,以為空格的打法是保持空白,所以要把空白取代時,中間要有一個空格” “

2.    處理完上述過程之後,發現有些資料沒有subdomain的資料,所以在過濾missing data後,留下來的資料剩0列可使用。
3.    篩檢需要留下的變項,目前打算把subdomain刪掉,只保留NIHSSsubdomain,目前正在進行中。
4.    20190730 VISTA資料庫連接不上

[文獻閱讀]Machine Learning-Based Model for Prediction of Outcomes in Acute Stroke.


研究目的:
比較不同分析模型預測急性中風患者long-term outcome之間的差異。本研究使用machine learning (ML)的運算模型,希望能提升急性中風患者long-term outcome的預測能力。

方法:
本研究使用了ML的三種運算法和傳統的分析方式,比較使用ML是否會比傳統的預測模型更具效能
研究者使用了2種不同的預測模型:(1) 納入所有資料的變項;(2) 僅納入包含在ASTRAL量表中的6個變項。此兩種預測模型利用ML的三種運算法:(1) deep neural network; (2)random forest; (3)regressionASTRAL量表的預測模型做比較。

結果:
結果顯示在納入所有變項的預測模型中,deep neural network的分析法比其他兩種運算法及ASTRAL量表能更有效預測急性中風患者得預後。由ROC curve的圖形來看,ROC曲線下的面積,deep neural networkASTRAL量表更具預測能力,並達到統計顯著[0.888 for deep neural network; 0.839 for ASTRAL scale]。然而,random forestregression的運算法雖然比ASTRAL量表有較好的預測能力,但未達統計顯著[0.857 for random forest; 0.849 for logistic regression]
在納入6個變項的預測模型中,3ML運算法雖然都比ASTRAL量表有稍好的預測能力,但皆未達統計顯著[0.853 for deep neural network; 0.828 for random forest; 0.846 for logistic regression]

討論:
本研究發現使用ML運算法相較ASTRAL量表,更能提升預測急性中風患者long-term outcome的預測能力。三種運算法中,deep neural network的預測效能在納入所有變項及6ASTRAL的變項時,顯著比其他兩種運算法及ASTRAL更好。所以deep neural network可能是最適合來預測long-term outcome的運算法。

限制:
本研究為單一機構收案,所使用的變項是該機構所使用的評估變項。研究結果可能受到不同機構使用不同評估變項影響。